Archives de l’Institut Pasteur de Tunis (2021) — Vol.98 (1-4) — https://doi.org/10.71612/pist-aipt-189514 — voir sur pist.tn
Escherichia coli est le principal agent pathogène responsable des infections urinaires. L’objectif de cette recherche était la caractérisation phénotypique et génotypique, ainsi que le typage des isolats urinaires d’Escherichia coli résistants à l’acide nalidixique chez les patients immunodéprimés. Durant la période d’étude de 2007 à 2011, la résistance aux quinolones a été observée dans 23 souches présentant 38% du total des isolats d’E. Coli dans l’urine avec une CMI50>256 μg/ml et seulement 17 souches étaient résistantes à la ciprofloxacine avec une CMI50>32 μg/ml. Une tendance à la hausse de la résistance aux fluoroquinolones a été observée pendant cette période. L’étude moléculaire a montré que la majorité des souches portent une double mutation dans GyrA avec une mutation simple au niveau de genes ParC ou ParE. En plus, on remarque une prévalence élevée de résistance à médiation plasmidique parmi nos souches. Le typage moléculaire par PFGE a montré la présence de 18 pulsotypes, ce qui indique l’absence de diffusion clonale dans notre centre. De plus, le variant du gène aac(6’)-Ib-cr fréquemment retrouvé dans ces souches pourrait conduire à la sélection de la résistance à la ciprofloxacine, il convient donc d’accorder plus d’attention à la consommation de fluoroquinolones et de renforcer la surveillance dans notre centre.
Keywords: Escherichia coli, quinolone resistant, onco-hematology, urinalysis
Résumé :Escherichia coli is the major pathogen responsible for urinary tract infection. The objective of this research was the phenotypic and genotypic characterization, as well as the typing of urinary Escherichia coli isolates resistant to nalidixic acid in immunocompromised patients. During a fiveyear period from 2007 to 2011, Quinolone resistant was observed in 23 strains (38% of total urinary E. coli isolates) quinolone resistant were isolated with MIC50 >256 μg/ml and only 17 strains were resistant to ciprofloxacin with MIC50 >32 μg/ml. An increasing trend of fluoroquinolone resistance was observed during this period. The most prevalent molecular resistance profile contained double mutation in GyrA with a single mutation in ParC and in ParE. A high prevalence of plasmid-mediated resistance was also noticed among our strains. Molecular typing with PFGE showed the presence of 18 pulsotypes which indicated the absence of clonal diffusion in our center. Moreover, The aac(6’)-Ib-cr gene variant frequently found in these strains could drive the selection of ciprofloxacin resistance, so more attention should be attached to the consumption of fluoroquinolones and surveillance should be reinforced in our center.