Archives de l’Institut Pasteur de Tunis (2006) — Vol.83 (1-4) — https://doi.org/04pwyer06 — voir sur pist.tn
"The nasopharyngeal carcinoma ( NPC) is frequent in Tunisia. It’s the second ORL cancer of men after the larynx one. To analyse the NPC characteristics in our population, we determined the frequency of EBV infection in 47 paraffin-embedded and 6 fresh NPC biopsies. We first extracted the DNA from tumoral tissus and then amplified viral sequences by PCR to detect and to type the infecting virus (EBV-A or ABV-B). Our results showed that amplifiable DNA has been obtained from 34/47 paraffin-embedded NPC biopsies while 13/47 of the others biopsies contained degraded and not amplifiable DNA. All the fresh biopsies allowed to obtain DNA with good quality. The EBV infection frequency in paraffin-embedded NPC biopsies is 35% while EBV is detected in all fresh biopsies (6/6). Our analyse also showed that the EBV-A is predominant in our population compared to EBV-B as it was shown in most countries of the world. This study clearly shows that PCR results obtained with paraffin-embedded NPC biopsies are divergeant from those obtained with fresh biopsies. Because of DNA degradation in paraffin-embedded NPC biopsies, the biology molecular results from that kind of samples is criticable. Moreover, the results obtained from fresh NPC biopsies confirmed the quasi-constant association of EBV with undifferenciated carcinoma nasopharyngeal type."
Keywords: Paraffin-embedded and fresh NPC biopsies, DNA extraction, EBV,NPC
Résumé :"Le carcinome du nasopharynx (NPC) est le second cancer ORL chez l’Homme après celui du larynx, en Tunisie. Dans le but d’analyser les caractéristiques du NPC dans notre pays, nous avons déterminé la fréquence de l’infection par l’EBV en analysant 47 biopsies enrobées en paraffine et 6 biopsies fraîches. Pour cela, l’ADN a été extrait à partir des tissus tumoraux puis amplifié par PCR pour détecter puis typer le virus infectant (EBV-A ou EBV-B). Nos résultats ont montré que de l’ADN amplifiable par PCR a été obtenu à partir de 34/47 biopsies enrobées en paraffine alors que les autres biopsies 13/47 avaient un ADN dégradé et non amplifiable. En revanche, toutes les biopsies fraîches ont permis l’extraction d’un ADN de bonne qualité. La fréquence d’infection par l’EBV des biopsies enrobées en paraffine a été de 35% alors que l’ADN viral a été détecté dans toutes les biopsies fraîches analysées (6/6). Notre analyse a également montré que l’EBV-A est prédominant dans le tissus tumoral du NPC par rapport à l’EBV-B. Cette analyse montre de biopsies enrobées en paraffine ne sont pas concordants avec ceux obtenus à partir de biopsies fraîches. Du fait de la dégradation de l’ADN dans les biopsies fixées et enrobées en paraffine, les résultats de biologie moléculaire obtenus à partir de ce type d’échantillon sont discutables. De plus, les résultats obtenus à partir de biopsies fraîches confirment la quasi-constante association de l’EBV avec le NPC de type indifférencié. "